Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MED13Q9UHV7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MED13Q9UHV7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms