Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
REREQ9P2R6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
REREQ9P2R6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
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