Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP35Q9P2H5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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