Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZDHHC3Q9NYG2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms