Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM53CQ9NYF3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms