Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CWC25Q9NXE8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CWC25Q9NXE8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms