Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHCHD3Q9NX63 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms