Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FANCLQ9NW38 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FANCLQ9NW38 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms