Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINM1Q9NU53 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms