Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms