Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC22A11Q9NSA0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC22A11Q9NSA0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms