Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA4BQ9NPR2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms