Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CENPJQ9HC77 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPJQ9HC77 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms