Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms