Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms