Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM3Q9BZL3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms