Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PUS3Q9BZE2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms