Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM54Q9BYV2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM54Q9BYV2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms