Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRIP1Q9BX63 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRIP1Q9BX63 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms