Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK19Q9BWU1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK19Q9BWU1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms