Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA3Q9BTC8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms