Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A3Q9BRY0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms