Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGME1Q9BQP7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGME1Q9BQP7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms