Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLF1Q9BQI6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms