Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SGIP1Q9BQI5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGIP1Q9BQI5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms