Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL13Q99616 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms