Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD1Q99460 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms