Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms