Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms