Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms