Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBP4Q96PP9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms