Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP3Q96P20 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms