Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms