Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms