Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDLIM2Q96JY6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms