Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHAMP1Q96JM3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHAMP1Q96JM3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms