Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCC12Q96J65 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCC12Q96J65 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCC12Q96J65 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC12Q96J65 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC12Q96J65 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC12Q96J65 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC12Q96J65 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC12Q96J65 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC12Q96J65 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms