Protein–RNA interactions for Protein: Q96HA7

TONSL, Tonsoku-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TONSLQ96HA7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TONSLQ96HA7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TONSLQ96HA7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms