Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FAM3DQ96BQ1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FAM3DQ96BQ1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FAM3DQ96BQ1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FAM3DQ96BQ1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FAM3DQ96BQ1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FAM3DQ96BQ1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FAM3DQ96BQ1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FAM3DQ96BQ1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FAM3DQ96BQ1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FAM3DQ96BQ1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FAM3DQ96BQ1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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FAM3DQ96BQ1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FAM3DQ96BQ1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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