Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms