Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms