Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO7Q8WWI1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms