Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms