Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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USP38Q8NB14 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP38Q8NB14 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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