Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms