Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GDPD3Q7L5L3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GDPD3Q7L5L3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GDPD3Q7L5L3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GDPD3Q7L5L3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GDPD3Q7L5L3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms