Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY3Q7L099 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms