Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q71RC1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q71RC1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q71RC1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q71RC1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q71RC1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q71RC1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q71RC1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q71RC1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q71RC1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q71RC1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q71RC1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q71RC1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q71RC1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms