Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC141Q6ZP82 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC141Q6ZP82 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms