Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00114Q6XXX2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00114Q6XXX2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms